Diatomées – méthodes Métropole et DOM

Fichiers en téléchargement

Les fichiers Excel (.xls) ont été développés pour Office 2000 et 2003. Ils s’ouvrent et fonctionnent généralement sans problème particulier sous Excel 2010 et 2013.

Attention : l’utilisation de modèles MS Excel sous d’autres tableurs (OpenOffice, LibreOffice) permet généralement d’utiliser les tableaux et les formules qu’ils contiennent, mais ne permet pas le fonctionnement de fonctions faisant appel aux macro-commandes (écrites en VisualBasic ©MS).

Les fichiers pdf nécessitent l’installation d’Acrobat Reader ou d’un utilitaire équivalent.

Pour l’utilisation de scripts de calcul dans le langage R, ce logiciel doit être installé au préalable sur le poste informatique.

 


 

Méthode diatomées métropole

ATTENTION : Les coordonnées géographiques sont à renseigner avec le système Lambert 93. Mais il est encore possible d’utiliser le système Lambert II étendu. Il faut par contre REMPLIR LES CHAMPS CORRESPONDANT RESPECTIVEMENT AU BON SYSTEME.

ATTENTION : le modèle de saisie et d’échange de données Diatomées cours d’eau a changé au 1er novembre 2017. Pour la saisie des résultats de mesures de surveillance et de transmission aux organismes responsables des données, il convient d’utiliser les formats téléchargeables sur le site de l’AFB. Cliquez ici

 

fichier description type taille version / date modifications de la dernière version
image_excel_logo fichier-taxo-diato xls
image_excel_logo Modèle de saisie de description station pour prélèvements diatomées RCS xls

71 ko

v5 sept 2016 mises à jour mineures de libellés
PDF fiche saisie terrain diatomées (version imprimable) pdf v4 Nov 2012

 

 

 


Méthode diatomées DOM

Scripts de calcul des indicateurs diatomées IDA-Indice diatomées Antilles et IDR-Indice diatomées Réunion

Les fichiers sont compressés au format .zip. Un utilitaire de décompression (WinRAR, 7-Zip, WinZip, PowerArchiver, FreeZip, etc.) est nécessaire pour les décompresser à leur format d’origine et reconstituer l’arborescence des fichiers.

Par exemple, pour l’IDA : Créer un dossier (IDA calcul), y placer le fichier IDA_1.0.zip, et utiliser la fonctionnalité « décompresser ici » de l’utilitaire de décompression.

Pour chaque indice, le package comprend le script de calcul (langage R), les données de référence (rdata) ou bibliothèques  nécessaires (csv) et une notice explicative (pdf). Ces outils sont utilisables avec une connaissance de base de l’utilisation du langage R.

L‘application R doit être installée sur l’ordinateur pour utiliser les outils du package.

 

fichier description type taille version / date modifications depuis la première version
zip package de calcul de l’IDA (script, référentiels, notice) zip.
25,2 Mo
 v 1.3
octobre 2016
. Correction de 2 erreurs mineures de la v1.1
. Correction d’une erreur dans la notice
zip package de calcul de l’IDR (script, référentiels, notice) zip
10,7 Mo
v 1.2
octobre 2016
. Version après correctifs de la version v1.0
. Correction d’une erreur dans la notice

Contact outils IDR et IDA : Sébastien Boutry, Julie Gueguen (Irstea Bordeaux)